怎么解除双方已分居多年的事实婚姻

可以协议解除，当事人就离婚财产分割问题达成协议的，只要该协议是当事人双方真实意思的表达并且不违法，就是有效的。离婚财产分割协议是指夫妻双方对离婚财产分割协议。签订的离婚财产分割协议不是在双方签字时生效的，因此，离婚财产分割协议生效前，如何办理离婚财产公证成为保证离婚财产分割协议生效的关键。

最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释(一)第五条规定，未按婚姻法第八条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，起诉到人民法院要求离婚的，应当区别对待：
(一)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理;
(二)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记;未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。

二、实婚姻与法律婚姻的区别：
1、从法律上说，事实婚姻是一种不合法的婚姻关系，它不受法律的保护;而合法婚姻是经《婚姻法》确认的婚姻关系，它不论何时何地都受法律的保护。
2、从人身关系上说，合法的婚姻关系一旦确立，夫妻双方即享有相互扶助的义务，任何情况下一方都不能随便遗弃另一方，否则将承担法律上的责任;而事实婚姻的双方却不享有这种确切的人身关系，一旦发生意外事件，无论是哪一方要求合法权利时都无法得到法律上的充分保护。

事实婚姻法律上是如何规定
3、从财产关系上说，合法婚姻所确立的财产关系是夫妻平等，两人自结婚登记后即享有家庭财产的共同所有权，一方不能以另一方收入低于自己而否认对方的这种平等的权利(另有约定的除外)，甚至以后夫妻关系如果发生变化，这种财产关系的平等性也不会发生变化;而事实婚姻却无法保障这种财产关系平等性与合法性，以后一旦发生争端，弱势方的合法权益将无法得到保障。
4、从子女抚养方面来说，合法婚姻关系的夫妻双方都负有抚养子女相同义务，即使是双方的婚姻关系结束，任何一方也不能免除抚养未成年子女的义务;但是事实婚姻却因为其婚姻关系在适用法律上就有困难，因而一旦婚姻关系发生变故，子女的抚养问题也无法得到很好的解决。
5、从财产的继承上来说，合法婚姻关系所产生的夫妻双方分别为对方的第一继承人，一方发生意外或者死亡，对方是法律上的第一财产继承人，任何人都无权剥夺;而事实婚姻却无法保障这种财产继承权。
6、从双方要求离婚时所产生的法律后果来看，法律婚姻经调解不成的，司法机关可以判决双方不准离婚以保护其中一方的合法权益，而事实婚姻在调解不成的情况下却只能判决解除双方的这种婚姻关系。

怎么解除双方已分居多年的事实婚姻?

只有在94年之前建立的同居关系才算是事实婚姻，94年之后法律已经取消了事实婚姻。在解除两人关系时有财产分配上的纠纷，双方都不肯退让怎么办，欢迎咨询了解，找专业的律师为你详细讲解清楚。